猪清场后，用农药是不能杀死猪舍里的病毒的，农药只能杀死猪舍里面的一些小虫虫，比如蟑螂，蚂蚁，鼠妇（我们这里叫地虱婆）这些昆虫类，而要想杀死猪舍里的病毒，这必须用专用的消毒水。
猪清场后第一件事情就是要把猪舍里的卫生打扫干净，把猪屎猪尿及时清除掉，并彻底把猪舍洗一遍，洗的时候可以撒上适量的生石灰粉在上面，生石灰粉遇水会沸腾，产生高温把病毒杀死。洗干净后的猪舍就要用消毒水里里外外彻彻底底的喷洒一遍，在猪舍外围和过道上面可以用生石灰粉给它洒一遍，如果猪圈内撒生石灰粉在下一茬养猪前就要彻底清扫干净，避免出现猪去舔食生石灰粉。撒生石灰粉的时候要戴上口罩，生石灰粉会呛鼻。
把猪舍里面喂猪的工具，桶、瓢、盆、等这些工具要用漂白粉进行消毒一次，避免病毒残留在这上面，会引发下一次的感染。猪舍内不用的木板，应当把它收集在一起焚烧掉，很多病毒都惧怕高温，燃烧可以烧死病毒。
猪舍内消毒要用专用的消毒水，比如复合酚，复合酚的颜色为深红褐色粘稠液体，有特臭和刺鼻。如果是喷洒，把复合分配成0.3%至1%的水溶液进行喷洒，浸涤则配成1.6%的水溶液进行浸涤，浸涤最好戴上手套进行操作，因为复合酚对皮肤黏膜有刺激和腐蚀性的作用，用量上一定要按比例配比。
如果猪舍使用农药消毒，会为下一茬养猪带来安全隐患，农药毕竟是毒药类，农药残留物过多，下一茬养猪，猪会舔食到农药残留物，引发猪中毒，这是不可取的，所以猪舍内消毒不能使用农药。只能用专用的动物类消毒液进行消毒。
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