根据水稻种子认证生产的要求，水稻种子生产及其质量控制的最低标准如下：
（1）前作。不应有自生植株，杂草应控制在一定数量内。
（2）隔离。空间隔离距离：常规种、保持系、恢复系原种田≥50米；常规种、保持系、恢复系大田用种田≥20米；不育系原种田≥700米；不育系大田用种田≥500米；籼型杂交稻制种田≥200米；粳型杂交稻制种田≥500米。
如有其他适宜的有效保护措施，可结合实际降低上述隔离距离的要求。
（3）种子田生长要求。经田间检验，种子田质量应达到：
①田间杂株率应达到：常规种：原种≤0.08%，大田用种≤0.1%；不育系、保持系和恢复系：原种≤0.01%，大田用种≤0.08%；杂交种制种田：父本≤0.1%，母本≤0.1%。
②散粉株应达到：杂交制种田任何一次花期检查≤0.2%或两次花期检查累计≤0.4%。
③没有检疫性病害和发病率高的病害。
（4）种子物理质量。经种子检验，物理质量应达到：净种子≥98.0%；发芽率≥80%（常规种≥85%）；水分≤13.0%（粳稻≤14.5%）。
（5）种子遗传质量。经小区种植鉴定，品种纯度应达到：常规种：原种≥99.9%，大田用种≥98.0%；不育系、保持系和恢复系：原种≥99.9%；大田用种≥99.0%；杂交种：一级标准≥98.0%，二级标准≥96.0%。