国家规定的种子质量标准有四个方面：种子纯度95%以上、发芽率90%以上（无籽西瓜除外）、净度99%以上和含水量8%以下。除了“早鉴”品种能在苗期快速鉴定出种子纯度外，一般的品种必须在大田出瓜胎或结瓜后才能看出种子纯度。种子净度可直观识别，种子含水量与种子耐贮性、发芽率密切相关。一般种子湿度大时不耐贮藏，芽率下降较快，种子还易发霉。因此，种子质量的鉴别主要是测种子的发芽率。
种子发芽率的鉴定包括两个方面：①种子的发芽率即100粒种子的发芽粒数，可反映种子的利用率。用公式表示为：种子发芽率（%）=（发芽的种子粒数/供试的种子粒数）×100。②种子的发芽势是指种子在规定时间内的发芽率，它用来表示西瓜种子发芽的快慢和整齐度，可反映出种子的新旧程度。用公式表示为：种子发芽势（%）=（规定时间内发芽的种子粒数/供试种子粒数）×100。从数值上看，种子的发芽势应小于种子的发芽率，但从重要性来看，种子的发芽势更能反映出种子的质量，种子发芽势好的种子，种子发芽率就好；反之，种子发芽率好的种子，种子发芽势却不一定好。再者，种子发芽率的检测时间长，需要5～7天，而发芽势的检测时间短，只需要2～3天，所以一般情况下只检测种子的发芽势即可。新种子经凉水（20℃）浸种24小时，在33℃条件下发芽1～2天，发芽率应在90%以上。西瓜杂交种子的质量标准有:
一级种：纯度> 9 8 . 0 % , 净度>99. 0 % ，发芽率> 9 0 % ，水分 <8.0%;
二级种：纯度> 9 5 . 0 % , 净度>99.0%，发芽率> 9 0 % , 水分 < 8 . 0 % 。
