确实，水果贵是很多去过日本的人的直观感受，水果都是论个卖。一个西红柿15元人民币，一个西瓜150元人民币。这不是贵，这简直是太贵了。其中的原因题主说对了一点，日本是个岛国，多山地，可用于种植的耕地很少，就算农业再发达，也架不住没地种呀，这就导致了日本果蔬从量上来说整体偏少。日本果蔬贵还有其他原因。
（北海道心形西瓜以3万人民币的价格拍卖）
日本人的性格决定了要做就做精做细，在水果种植上也不例外。日本的水果简直是“贵族”般的待遇，相比我们这边水果批发市场一堆一堆的水果，日本将水果做成了艺术品，不仅包装讲究，在商超中的摆放也很上档次，让人看了觉得“就该卖这么贵。”
另外，日本人在农业发展，科学研究上也是下足了工夫，许多品种都是从实验室里研发出来的，不仅品相好，而且还好吃，甚至你吃了再也不想尝其他水果了。这种高投入，高品质，精包装的流程，也是当地水果贵的一个主要原因。
（一串葡萄单独包装）
日本历来重视农业，如此高的价格有利于维护农民利益日本民族历来都有危机意识，粮食是一个国家的生命线，日本的农业人口占10%，这在发达国家是很少见的。日本政府将农业看作是立国之基，高价的农产品有助于维护农民的积极性。
我们可能会说，那日本为什么不进口其他国家的水果呢？不说也能想到原因，日本的海关检疫太严格了，很多国家的产品都过不了这一关。
不过，话说回来，在日本本来生活成本就很高，也许当地人已经对此习以为常了，只是我们少见多怪了。
其实最主要的一条原因，就是政府对农业和农民的保护政策和保护制度。
日本农业家庭的人口占总人口的7%左右，虽然比例不是很高，但日本农民的地位和收入并不低，不仅有全国和地方农业协会这样具有高度组织性的组织为农民发声和争取利益，而且很多地方手握选票的农民成为政党们争相讨好的对象，任何政党都不敢轻视农民群体，长期执政的自民党为了保持农村这一重要票仓，极力维护农民的利益，并与农协保持着良好的互助互利关系。
为了确保日本农民的收入和地位相匹配，必须要维持农户的收入不能过低，日本农民的平均年收入超过700万日元左右，与地方公务员大致相当，但由于日本户均耕作面积小，为了拉高农民的收入就不得不保持农产品的高价格。且在日本国内，农产品的价格基本上是由农民组成的农业协会协调确定的，这就确保了农民们的利润。
除了国内有农业协会在维护农产品的利润外，日本政府一直实施着比较特殊的农产品关税制度，与日本国内固定8%的消费税不同，日本农产品关税并非固定收百分之多少的税，而是参考国内农户的出货价格，进口农产品的税可以收到与国内价格有一定的可比性为止。
故而，高关税保护着日本国内农民免受国外农产品的冲击。而且日本对国内外农产品的检验检疫要求极其严格，甚至超过美国和欧洲，故而，食品安全为日本构建非关税壁垒提供了一个名正言顺的理由。
其实从日本国内的恩格尔系数以及国民人均收入水平来看的话，较高的农产品价格并非是负面的事情，过低的农产品价格反而会给农民和农村带来极大的冲击，进而对日本社会造成不稳定的影响。