微生物主要分为以下几类:(更详细与严谨的分类请参阅微生物分类表)
原核微生物
细菌(Bacteria)
古菌(Archaea)
真核微生物
真菌(fungus)
霉菌
酵母
担子菌
原生动物(protozoan)
藻类(algae)
无细胞生物
病毒(virus)
类病毒(virusoid)
拟病毒(viroid)
朊粒(亦称朊病毒、蛋白质质感染性颗粒)(prion)
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原核微生物
细菌(Bacteria)
古菌(Archaea)
真核微生物
真菌(fungus)
霉菌
酵母
担子菌
原生动物(protozoan)
藻类(algae)
无细胞生物
病毒(virus)
类病毒(virusoid)
拟病毒(viroid)
朊粒(亦称朊病毒、蛋白质质感染性颗粒)(prion)