其实，最早提出这个问题的人是英国的阿伯丁罗特研究所的普庇泰教授。1998年，他在研究中发现，幼鼠食用转基因土豆后，会使内脏和免疫系统受损。这引起了科学界的极大关注。随即，英国皇家学会对这份报告进行了审查，于1999年5月宣布此项研究“充满漏洞”。1999年英国的权威科学杂志《自然》刊登了美国康乃尔大学教授约翰·罗西的一篇论文，指出蝴蝶幼虫等田间益虫吃了撒有某种转基因玉米花粉的菜叶后会发育不良，死亡率特别高。目前尚有一些证据指出转基因食品潜在的危险。
但更多的科学家的试验表明转基因食品是安全的。赞同这个观点的科学家主要有以下几个理由。首先，任何一种转基因食品在上市之前都进行了大量的科学试验，国家和政府有相关的法律法规进行约束，而科学家们也都抱有很严谨的治学态度。另外，传统的作物在种植的时候农民会使用农药来保证质量，而有些抗病虫的转基因食品无需喷洒农药。还有，一种食品会不会造成中毒主要是看它在人体内有没有受体和能不能被代谢掉，转化的基因是经过筛选的、作用明确的，所以转基因成分不会在人体内积累，也就不会有害。
比如说，我们培育的一种抗虫玉米，向玉米中转入的是一种来自于苏云金杆菌的基因，它仅能导致鳞翅目昆虫死亡，因为只有鳞翅目昆虫有这种基因编码的蛋白质的特异受体，而人类及其它的动物、昆虫均没有这样的受体，所以无毒害作用。
1993年，经合组织（OECD）首次提出了转基因食品的评价原则——“实质等同”的原则，即：如果对转基因食品各种主要营养成分、主要抗营养物质、毒性物质及过敏性成分等物质的种类与含量进行分析测定，与同类传统食品无差异，则认为两者具有实质等同性，不存在安全性问题；如果无实质等同性，需逐条进行安全性评价。
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”荣获“全国种粮大户”称号的浙江省龙游县横山镇大平坂村农民柴茂清指着两块田里的秧苗对记者说。针对使用农药的诸多不利因素，拜耳作物科学在中国提出了一个创新理念的项目——“水稻”项目，为水稻农户提供的一种“与众不同”的作物解决方案及服务。“水稻”项目的推广，在农民眼中是一种真真正正的实惠，而在拜耳作物科学地区技术经理蒋学辉看来，最大的意义还在于它的生态价值。
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烟嘧磺隆 玉农乐 nicosulfuron 4%SC 玉米 禾本 茎叶喷雾，玉米3-4叶期，杂草5cm 2叶下5叶上敏感，有机磷处理过的玉米对该药敏感需间隔7天，可与菊酯类共用。施药6小时候下雨无影响。 速效性好，施药后5-7天杂草开始变色枯萎。
甲基磺草酮 千层红 mesotrione 15SC 玉米 阔叶 土壤处理，茎叶处理 触杀 3-5天后，出现黄化继而整株死亡
氯氟吡氧乙酸 使它隆 fluroxypyr 20EC 玉米，旱田 阔叶 茎叶喷雾，玉米苗后6叶期之前，杂草2-5叶期 气温低，风速小时喷雾
乙草胺 禾耐斯 Acetochlor 50EC 玉米，阔叶，葱蒜 禾本 播种前后，谷类瓜类，韭菜对敏感 干旱用混土法
甲草胺 Alachlor 48EC 玉米，阔叶，甘蔗 一年生，菟丝子 作物播后出苗前，番茄辣椒洋葱萝卜等蔬菜田除草 在播种前或移栽前 干旱用混土法，对已出土杂草无效
莠灭净 Ametryn 50SC80WP 玉米甘蔗香蕉菠萝 一年生 苗前用药，苗后3-4叶期，间隔期3-4个月 喷洒时防止漂移沙土不宜使用一年不能种敏感作物
莠去津 阿特拉津 Atrazine 40SC50WP 玉米高粱果树苗圃 一年生 玉米播种后出苗前，玉米4叶期时甘蔗种下5-7天
果树45月份已出土杂草先铲除土表喷雾 持效期2-3月，不宜在桃树豆类使用
芽前处理，土壤处理。
二甲戊灵 施田补 Pendimethalin 33EC 玉米旱田 禾本 土壤处理，播种后出苗前 水分低粘土用量高，干旱地药后混土
3-5cm甜菜瓜西瓜菠菜敏感，吸附强